Musíš svoj problém popísať podrobne a dodržiavať zaužívanú terminológiu. Takže budem trochu veštiť.
Mňa mätie, že si vytváral na jedenkrát 5 častí a výsledok sú dva priečinky - malý a veľký. Logika hovorí, že by si mal dostať 5 resp. 10 priečinkov (podľa nastavenia MOBACu).
JNX konverter nepoznám, máš asi na mysli MOBAT2JNX.
Ďalej, to iba predpokladám (podľa veľkosti priečinka), že si vytváral Google satelitné mapy programom MOBAC, a že si mal zaškrtnuté všetky zoom levely až po zoom level 17. Ďalej predpokladám, že si si vybral formát výstupnej mapy OSM Tracker tile storage. Výsledkom pre jeden výber má byť jeden priečinok, v ktorom sa nachádzajú priečinky s číslami vybratých zoom levelov. Dva priečinky máš možno preto, že máš v MOBACu nastavenú menšiu veľkosť mapy ako je tvoj výber. Choď do SETTINGS -- MAP SIZE a vyber najväčšiu možnú veľkosť mapy v pixeloch, t.j. 1048575.
Ďalej pokračuj podľa návodu.
Budeš nabudúce vedieť, ako popísať problém, aby sme iba neveštili?

Edit: Tu píšu 16 GB:
http://www.garmin.sk/dakota-20-sk-topo-_d2300.html To ale neznamená, že 32 nebude fungovať, treba vyskúšať.